Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn2Q8CHX7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rftn2Q8CHX7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rftn2Q8CHX7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms