Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Setd1bQ8CFT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Setd1bQ8CFT2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Setd1bQ8CFT2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Setd1bQ8CFT2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms