Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl1Q8CEQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms