Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc178Q8CDV0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc178Q8CDV0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms