Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad2Q8CDM1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad2Q8CDM1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atad2Q8CDM1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad2Q8CDM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms