Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
6030452D12RikQ8CD33 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
6030452D12RikQ8CD33 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6030452D12RikQ8CD33 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms