Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa5Q8C7G5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoa5Q8C7G5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa5Q8C7G5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms