Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmnQ8C5W0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ClmnQ8C5W0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ClmnQ8C5W0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmnQ8C5W0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms