Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef5Q8C0Q9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef5Q8C0Q9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef5Q8C0Q9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms