Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkrfQ8BY02 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkrfQ8BY02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NkrfQ8BY02 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NkrfQ8BY02 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkrfQ8BY02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkrfQ8BY02 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkrfQ8BY02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkrfQ8BY02 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms