Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Iffo1Q8BXL9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Iffo1Q8BXL9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iffo1Q8BXL9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms