Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXK9

Clic5, Chloride intracellular channel protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic5Q8BXK9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clic5Q8BXK9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clic5Q8BXK9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic5Q8BXK9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic5Q8BXK9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms