Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx17Q8BVL3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx17Q8BVL3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx17Q8BVL3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx17Q8BVL3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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