Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms