Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUG5

Caps2, Calcyphosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caps2Q8BUG5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caps2Q8BUG5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Caps2Q8BUG5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Caps2Q8BUG5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caps2Q8BUG5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caps2Q8BUG5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caps2Q8BUG5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caps2Q8BUG5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caps2Q8BUG5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms