Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rd3Q8BRE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rd3Q8BRE0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rd3Q8BRE0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms