Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnpy4Q8BQ47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy4Q8BQ47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms