Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
5730596B20RikQ8BQ08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms