Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efemp1Q8BPB5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efemp1Q8BPB5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efemp1Q8BPB5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efemp1Q8BPB5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms