Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E130116L18RikQ8BMV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E130116L18RikQ8BMV6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E130116L18RikQ8BMV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.8 ms