Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf3c4Q8BMQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c4Q8BMQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms