Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rab3gap2Q8BMG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab3gap2Q8BMG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab3gap2Q8BMG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab3gap2Q8BMG7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rab3gap2Q8BMG7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms