Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem260Q8BMD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem260Q8BMD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem260Q8BMD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem260Q8BMD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms