Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL66

Eea1, Early endosome antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eea1Q8BL66 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Eea1Q8BL66 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Eea1Q8BL66 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Eea1Q8BL66 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Eea1Q8BL66 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Eea1Q8BL66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Eea1Q8BL66 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Eea1Q8BL66 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Eea1Q8BL66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Eea1Q8BL66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Eea1Q8BL66 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Eea1Q8BL66 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,4 ms