Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms