Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc40Q8BI79 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc40Q8BI79 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc40Q8BI79 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms