Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vipas39Q8BGQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vipas39Q8BGQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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