Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Best2Q8BGM5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Best2Q8BGM5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best2Q8BGM5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms