Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4bQ8BGE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4bQ8BGE6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4bQ8BGE6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4bQ8BGE6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4bQ8BGE6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4bQ8BGE6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282 ms