Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trmt12Q8BG71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trmt12Q8BG71 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms