Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sv2bQ8BG39 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Sv2bQ8BG39 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sv2bQ8BG39 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms