Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Clca2Q8BG22 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clca2Q8BG22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clca2Q8BG22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Clca2Q8BG22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clca2Q8BG22 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms