Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc181Q80ZU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc181Q80ZU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc181Q80ZU5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc181Q80ZU5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms