Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zer1Q80ZJ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zer1Q80ZJ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zer1Q80ZJ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms