Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Amigo1Q80ZD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Amigo1Q80ZD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amigo1Q80ZD8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms