Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TnnQ80Z71 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TnnQ80Z71 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TnnQ80Z71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
TnnQ80Z71 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TnnQ80Z71 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TnnQ80Z71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TnnQ80Z71 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TnnQ80Z71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TnnQ80Z71 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
TnnQ80Z71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms