Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg2bQ80XK6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg2bQ80XK6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg2bQ80XK6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms