Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc12Q80WJ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc12Q80WJ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc12Q80WJ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc12Q80WJ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc12Q80WJ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms