Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WhrnQ80VW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WhrnQ80VW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms