Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2eQ80UW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2eQ80UW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr2eQ80UW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms