Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec16aQ80U30 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec16aQ80U30 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec16aQ80U30 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms