Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vtcn1Q7TSP5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vtcn1Q7TSP5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vtcn1Q7TSP5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms