Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClmQ7TSN2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ClmQ7TSN2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClmQ7TSN2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms