Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccp110Q7TSH4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccp110Q7TSH4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccp110Q7TSH4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms