Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1cQ7TSF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1cQ7TSF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1cQ7TSF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms