Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox11Q7M6Y2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sox11Q7M6Y2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox11Q7M6Y2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms