Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl2Q78Y63 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl2Q78Y63 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms