Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GypcQ78HU7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GypcQ78HU7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GypcQ78HU7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms