Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1cQ76I25 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Higd1cQ76I25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd1cQ76I25 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms