Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2d2bQ6ZWY6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms